Asosiasi Gen Myostatin Ekson 3 dengan Sifat Pertumbuhan pada Sapi Bali
DOI:
https://doi.org/10.30736/asj.v5i01.86Abstract
Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Januari 2020. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi keragaman SNP (Single Nucleotide Polymorphism) gen myostatin di daerah ekson 3 dan asosiasinya dengan sifat pertumbuhan pada sapi Bali. Materi penelitian menggunakan sampel darah diambil dari 52 ekor sapi bali jantan berasal dari BPTU-HPT Denpasar. Analisis DNA dilakukan secara bertahap yaitu mulai dari mengekstraksi DNA, mengamplifikasi gen MSTN dengan metode PCR dan melakukan sekuensing. Data hasil sekuensing selanjutnya dianalisis dengan menggunakan FinchTV, BioEdit dan MEGA7. Amplifikasi gen MSTN di daerah ekson 3 pada sapi bali berhasil dilakukan pada suhu 60 oC dengan panjang produk 451 pb. Dalam penelitian ini ditemukan 13 SNP dengan Frekuensi alel SNP yang ditemukan berada dalam keadaan equilibrium. Hasil asosiasi SNP Terdapat 3 SNP yaitu c.4900 T>G, c.4905 C>G dan c.4907 C>G yang berpengaruh nyata (P<0.05) terhadap bobot lahir pada sapi bali. Hasil penelitian yang mengungkap hubungan antara beberapa SNP gen MSTN yang berasosiasi dengan bobot lahir diharapkan dapat dijadikan sebagai kandidat penanda genetik bobot lahir sapi bali.
Downloads
References
[BPS] Badan Pusat Statistik. 2021. Provinsi Bali dalam Angka 2019. Bali (ID): BPS Provinsi Bali.
[BSN] Badan Standarisasi Nasional. 2017. Bibit Sapi Potong bagian 4: Bali. Jakarta (ID): SNI 7651-4:2017.
Cieslak D, Blicharski T, Kapelaski W, Pherzchala M. 2003. Investigation of polymorphisms in the porcine myostatin (GDF8; MSTN) gene. Czech J Anim Sci. 48(2):69-75.
[DGLS] Directorate Generale of Livestock Services. 2003. National Report on Animal Genetic Resources in Indonesia. Directorate of Livestock Breeding (ID): Directorate Generale of Livestock Services.
Dominic JE, Gerard C. 2006. Myostatin regulation of muscle development: molecular basic, natural mutation, physiopathological aspects. Experimental cell research. 312(13):2401-2414.
Elsalam KAA. 2003. Bioinformatic tools and guideline for pcr primer design. African Journal of Biotechnology. 2(5):91-95.
Hafid H, Rugayah N. 2009. Persentase karkas sapi bali pada berbagai berat badan dan lama pemuasaan sebelum pemotongan. Prosiding Seminar Nasional Teknologi Peternakan dan Veteriner. 2009, 1(1):77-85.
Hardjosubroto. 1994. Aplikasi Pemuliabiakan Ternak di Lapangan. Jakarta (ID): Gramedia Widiasarana Indonesia.
Khasanah H, Gunawan A, Priyanto R, Ulum MF, Jakaria. 2016. Polymorphism of myostatin (MSTN) promoter gene and its association with growth and muscling traits in bali cattle. Media Peternakan. 39(2):95-103.
Lee PY, Costumbrado J, Hsu CY, Kim YH. 2012. Agarose gel electrophoresis for the separatin of DNA fragments. J. Vis Exp. 62:3923.
Lonetti A, Fontana MC, Martinelli G, Lacobucci I. 2016. Single nucleotide polimorphisms as genomic markers for high-throughput pharmacogenomic studies. Methods Molecular Biology. 1368:143-159.
Nei M, Kumar S. 2000. Molecular Evolution and Phylogenetics. New York (USA): Oxford Univ Pr.
Noor RR. 2010. Genetika Ternak. Edisi ke-6. Jakarta (ID): Penebar Swadaya.
Oldham JM, Martyn JAK, Sharma M, Jaenplong F, Kambadur R, Bass JJ. 2001. Molecular expression of myostatin and MyoD is greater in double-muscled than normal-muscled cattle fetuses. Am J Physiol Regulatory Integrative Comp Physiol. 280: R1488-R1493.
Talib Chalid. 2002. Sapi bali di daerah sumber bibit dan peluang pengembangannya. Wartazoa. 12(3):100-107.
Taylor WE, Bhasin S, Artaza J, Byhower F, Azam M, Jr Willard DH, Jr Cull FC, Gonzalez CN. 2001. Myostatin inhibits cell proliferation and protein synthesis in C2C12 muscle cells. Am J Physiol Endo Metab. 280(2): E221– E228.
Zhang C, Liu Y, Xu D, Wen Q, Li X, Zhang W, Yang L. 2011. Polymorphisms of myostatin gene (MSTN) in four goat breeds and their effects on boer goat growth performance. Mol Biol Rep. 39(3):3081-3087.
Zhang C, Liu Y, Xu D, Wen Q, Li X, Zhang W, Yang L. 2011. Polymorphisms of myostatin gene (MSTN) in four goat breeds and their effects on boer goat growth performance. Mol Biol Rep. 39(3):3081-3087.
Zhang RF, Chen H, Lei1 CZ, Zhang CL, Lan XY, Zhang YD, Zhang HJ, Bao B. Niu H, Wang XZ. 2007. Association between polymorphisms of mstn and myf5 genes and growth traits in three chinese cattle breeds. AJAS. 20(12):1798-1804.
Zulkharnaim, Jakaria, Noor RR. 2010. Identification of genetic diversity of growth hormone receptor (GHR|Alu I) gene in bali cattle. Media Peternakan. 33:81-87.
Additional Files
Published
How to Cite
Issue
Section
License
Copyright (c) 2022 wenny ladhunka, Jakaria
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.
